MacGyver hilft einem Wissenschaftler, der auf der Suche nach einer Hochschülerin ist. Gemeinsam mit ihr hat der Forscher eine technische Anlage zum Steuern von Flugkörpern konzipiert. Nachdem Kriminelle diese Flugkörper gestohlen haben und die Hochschülerin dazu das Pentagon gegen sich aufgebracht hat, ist sie nun in größter Gefahr.





