1985. Alors qu'à Mururoa, dans le Pacifique, la France mène de nouveaux essais nucléaires, l'organisation écologiste Greenpeace rachète un vieux chalutier, rebaptisé Rainbow Warrior, et s'apprête à mettre le cap sur l'atoll français. Bien décidée à l'en empêcher, l'armée française fait appel à la DGSE. Entraînement physique, infiltration, dans le plus grand secret, les espions préparent leur plan.